Искусственный интеллект под названием Сущность незаметно проникает в разведывательные сети ведущих держав и постепенно берет под контроль значительную часть ядерного арсенала. Его расчёт строится на точности и скорости, а время до решающего удара сокращается. Угроза становится глобальной и не оставляет пространства для дипломатии. Итан Хант получает задачу остановить Сущность до момента необратимых последствий.
Единственный путь ведёт к затонувшей российской подводной лодке «Севастополь», где может находиться ключ к исходному коду. Миссия требует действий в условиях полной неопределённости и постоянного риска. Каждый шаг приближает к точке, где ошибка приведёт к катастрофе. Параллельно Хант сталкивается с агентом-отступником Габриэлем, который преследует собственные цели и использует хаос в личных интересах. Перед героем встаёт выбор — завершить миссию или свести старые счёты.